一、开始前的准备
1. ChatGPT 桌面应用
安装新版 ChatGPT 桌面应用（之前叫Codex，现在合并了）
Windows在微软商店进行安装
Mac端、Win端用户都可以访问：
国内环境访问不了的，可以试试通过我的压缩包解压Codex install安装包
2. CC Switch
本文建议使用 CC Switch 3.16.1 或更高版本，建议直接安装最新稳定版。
3.16.0 版本开始支持把 Codex 的 Responses API 请求转换为 DeepSeek 等供应商使用的 Chat Completions 请求；不需要再结合Codex++等其他软件了
打开👇官方仓库首页：
或者直接访问安装包首页然后选择最新版本安装：
国内网络问题加载缓慢的可以下载下面这个Watt Toolit软件进行加速（GitHub）
安装好后不需要注册即可免费开启加速访问GitHub
安装完成后打开CC Switch即可
刚开始进入是空白的，因为DeepSeek等客户端还没有进行配置（后文会交代配置）
3. DeepSeek API Key
API Key获取地址：
需要在 DeepSeek API 控制台中创建 API Key，并保证账户有可用余额。API 调用会根据实际 token 使用量计费。
4. Zotero
准备zotero桌面版，没有的可以到官网下载
二、开始配置
1. 在CC Switch中添加 DeepSeek 供应商
到DeepSeek开放平台认证好个人信息后，创建API Key，名称任意填写
API Key只会出现一次，记得复制好保存到其他地方，不要泄露！
回到CC Switch，在顶部点击左上角齿轮⚙️图标打开设置
回到首页，选择Codex，点击右上角的加号，添加新的供应商。
找到DeepSeek
然后填写自己的 DeepSeek API Key。
其他配置尽量保持预设值，然后添加即可
DeepSeek 官方提供的是 OpenAI Chat Completions 兼容接口，而 Codex 主要按照 OpenAI Responses API 发送请求。两种协议的请求体、流式事件和工具调用格式并不相同，所以我需要开启本地路由接管本地使用Codex发送的请求和DeepSeek 发送的回复
因此要保证首页左上角这个图标是开启的，同时确保选中开启的是的DeepSeek模型
2. 打开Codex客户端
启动Codex APP，如果已经开启，需要在DeepSeek配置并启动后重新启动客户端
前面操作没有问题是可以直接正常打开访问的
然后点击左侧栏插件，然后搜索
Zotero，进行安装即可
做完这一步已经整个流程已经搞定了
保险起见，可以打开Zotero的设置，打开这个选项，可以让zotero的文献暴露给Codex访问，DeepSeek也能间接读取zotero文献
使用演示
直接在对话框开头输入
@zotero ，引用插件即可，选择最上面那个
和实际的zotero文献信息一样
这样以后DeepSeek可以直接读取你Zotero里面的文献，包括PDF批注、笔记等等一切它能读懂的内容！！！
当然，只读文献还是太局限了，能不能让它帮我整理笔记、形成文献矩阵和文献综述呢？
当然可以！！！
可以搭配其他大佬开发的科研用Skills（技能），这个是给大模型指导的提示词
告诉他怎么样进行文献阅读、文献结构和内容分析、如何匹配事实证据、如何查找文献
总之，目前互联网上（尤其是GitHub）已经开源了许多科研类SKILL
我也整理了一些科研用SKILL
感兴趣的可以私我
但是怎么使用呢？
很简单，让DeepSeek帮你安装SKILL就好
比方说安装这个文献阅读到写作的全流程SKILL
他会调用技能的要求从审稿人、编辑者、领域专家等视角进行文献精读，他会调用本地PDF技能进行文献解析拆分成纯文本结构，你看DeepSeek文本模型也能读懂PDF附件
当然，使用SKILL是一种用法，还有一种用法是使用MCP、插件
我自己也做了一个MCP工具、也内置了文献解读、图表解读、文献管理SKILL
其中最重要的是搭建了一个文献解析桥梁——MinerU
这个是将PDF解析成人类和大模型可读的markdown标记语言
我做了这么一个工具，是为了减轻大模型帮我读文献的成本和负担
因为Zotero里的PDF附件直接发给大模型，虽然能读，但是token数量占据很多，而且不好做笔记整理和文献关联
之前已经有zotero插件如GPT Pro、LLM for Zotero做的也很好
但是对于经常让AI Agent管理文献，可能不够方便，
然后对于文献笔记的整理，我推荐使用Obsidian进行整理，这是做笔记和初期文献撰写比较方便的本地开源软件
所以我现在做的事就是在Codex里面使用技能查找文献，然后人为筛选文献，通过浏览器的zotero插件把文献自动化导入到zotero，然后在Codex利用CC Switch配置DeepSeek模型帮我解读和管理文献，然后把文献同步导入到Obsidian进行精读
而我开发的这个Obsidian Vault MCP工具（见下文），就是在自动化这个流程，暴露给DeepSeek或者其他大模型使用，按照这个标准的流程更新每一篇zotero文献和笔记
安装 Obsidian Vault MCP
仅安装官方的 Zotero 插件，已经能读取大部分文献条目元数据
但读取结束后，内容通常只停留在当前对话中。为了把文献、PDF、全文、精读结果和综述长期沉淀到 Obsidian，可以继续安装 Obsidian Vault MCP。
项目地址：
版本要求 Python 3.10 以上，提供 31 个 MCP Tools、7 个科研 Skills 和 5 类结构化 Analysis，能够连接 Zotero、MinerU、Obsidian 与 Codex。
安装好Python和node.js后
使用CMD命令一键安装，没接触过命令行的小白可以直接把我上面参考地址发给Codex（DeepSeek）进行配置
参考提示词：
也可以自行使用CC Switch进行MCP配置
复制下面json代码
注意这里
"<VAULT_PATH>"双引号里面的内容等下粘贴后需要改成你的Obsidian实际vault仓库在CC Switch这里打开MCP配置页面
注意
MCP标题任意填写，能记住就行，但是json的vault参考一定要改为自己实际的参考地址，或者填auto
我还做了一期视频是展示如何使用WorkBuddy进行配置，实现WorkBuddy、Zotoro、Obsidian联动的完整教程
安装好后是这样子的形式
最后
总体来说，使用Codex接入DeepSeek的一个流程进行读取zotero文献的架构如下：
今天带大家完整的演示了一遍教程
手把手带你从零配置Codex接入DeepSeek读取zotero文献
相信在不久后的将来，读文献、找文献的效率会得到大大提升
人类要做的事情估计就剩下判断和审核把关
这或许才是科研大牛拿不走的护城河
好了，以上就是本期的全部内容啦，感谢你的喜欢和阅读
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